A Safari a létrehozásuk sorrendjében menti a könyvjelzőket és a könyvjelzőmappákat, és hozzáadja őket egy folyamatosan bővülő lista aljára. Ha továbbra is hozzáad könyvjelzőket a Könyvjelzők menühöz anélkül, hogy mappákba helyezné őket, akkor azt tapasztalhatja, hogy akarva-akaratlan könyvjelzők sokasága van felsorolva, és nem emlékszik, hogy ezeknek a fele mire hivatkozik.
Az idő múlásával valószínűleg vannak olyan könyvjelzői, amelyeket már nem használ – egyesek már nem is működnek. Az eljárás ugyanaz, ha az Oldalsávban vagy a Könyvjelzőszerkesztőben dolgozik. Kövesse az alábbi lépéseket, hogy logikusabb sorrendbe helyezze könyvjelzőit, és törölje azokat, amelyeket már nem szeretne:
A Safariban válassza a Könyvjelzők → Könyvjelzők szerkesztése menüpontot.
Vagy kattintson az Oldalsáv gombra, majd kattintson a Könyvjelzők fülre.

Kattintson az áthelyezni vagy törölni kívánt mappára (Oldalsáv), vagy kattintson a könyvjelzőt tartalmazó mappa neve melletti háromszögre (Könyvjelzőszerkesztő).
A tartalom, amely könyvjelzőket és további, más könyvjelzőket tartalmazó mappákat is tartalmazhat, az alábbiakban található.
Kattintson a további mappákra a benne lévő könyvjelzők megtekintéséhez. Előfordulhat, hogy ezt a lépést többször meg kell ismételnie a kívánt könyvjelző megtalálásához.
Kattintson és húzza a listában felfelé vagy lefelé mozgatni kívánt könyvjelzőt vagy könyvjelzőmappát egy új mappába vagy pozícióba.
Húzza a könyvjelzőt vagy mappát a mappa utolsó eleme fölé, ha ki szeretné helyezni a mappából. Egy sor mutatja, hova kerül az elem áthelyezése; ha áthelyezi egy mappába, a mappa ki van jelölve.
A Safari áthelyezi a kiválasztott könyvjelzőt az új helyre.
Kattintson és húzza fel és le a könyvjelzőket a gyűjteményben vagy mappában a megjelenítési sorrend megváltoztatásához.
A Könyvjelzőszerkesztőben kattintson a törölni kívánt könyvjelzőre, és nyomja meg a Törlés gombot.
Vagy az oldalsávon kattintson a Control billentyűt lenyomva tartva a nem kívánt könyvjelzőre, és válassza a Törlés parancsot az előugró menüből.
Ezzel a módszerrel is törölhet egy mappát, de a törölt mappán belüli összes könyvjelző és mappa törlődik.
A tévedésből törölt könyvjelző visszaállításához nyomja le a ⌘+Z billentyűkombinációt, vagy válassza a Szerkesztés → Könyvjelző eltávolításának visszavonása lehetőséget.
Válassza a Könyvjelzők➪Könyvjelzőszerkesztő elrejtése lehetőséget, hogy visszatérjen a legutóbb megtekintett weboldalra, vagy kattintson az Oldalsáv gombra az oldalsáv bezárásához.